Родился 13 (1) января 1866 года в селе Воины Орловской губернии в семье чиновника.
Учился в Орловской духовной семинарии, где начал обучаться музыке и некоторое время дирижировал хором.
В 1884 году поступил в подготовительные классы при Консерватории, однако, не имея возможности платить за обучение, через несколько месяцев был отчислен. Тем не менее, ему удалось получить место в Музыкально-драматическом училище Московского филармонического общества, где учился по классам фагота и композиции до 1891 года. Среди его педагогов были С.Н.Кругликов, А.А.Ильинский, П.И.Бларамберг.
Не имея надёжного заработка, Калинников периодически играл в театральных оркестрах на скрипке, фаготе или литаврах, а также заниматься переписыванием нот. Поддержку музыканту оказывал музыкальный критик Семён Кругликов, одобрительно отзывался о его таланте Пётр Чайковский, рекомендовавший его на пост дирижёра Малого театра в 1892 году. Помимо дирижёрской деятельности, Калинников в этот период давал частные уроки теории музыки и пения.
Наиболее известное сочинение Калинникова — Первая симфония g-moll, написанная в 1895 году и посвящённая Кругликову. Впервые исполненная на концерте Русского музыкального общества в Киеве, она имела огромный успех и вскоре прочно вошла в репертуар как отечественных, так и зарубежных оркестров.
Умер 11 января 1901 года (29.12.1900) в Ялте.
Был старый король (Г.Гейне/А.Плнщеев)
Константин Плужников
Звёзды ясные (К.Фофанов)
Константин Плужников
Когда жизнь гнетут и страданья и муки (Поливанов)
Константин Плужников
Колокола (К.Романов)
Николай Алексеев
Молитва (А.Плещеев)
Николай Алексеев
На старом кургане (И.Никитин)
Николай Алексеев
Владимир Касторский
Максим Михайлов
Александр Пирогов
Марк Рейзен
Иван Скобцов
На чудное плечико милой (Г.Гейне/В.Фёдоров)
Константин Плужников
Нам звёзды кроткие сияли (А.Плещеев)
Николай Алексеев
Не спрашивай, зачем (А.Пушкин)
Николай Алексеев
Я желал бы свои песни (Г.Гейне/В.Фёдоров)
Константин Плужников
Я ли тебя, моя радость (Г.Гейне/В.Фёдоров)
Константин Плужников